La investigación se realiza sobre una muestra de unos 3.000 alumnos y alumnas de Educación Primaria (cursos 5º y 6º) y otra muestra similar para Educación Secundaria Obligatoria (cursos 1º, 2º, 3º y 4º). En concreto, en el año 2008 han participado 84 centros educativos en la muestra de Educación Primaria y 80 en la de Educación Secundaria.
La gestión de la investigación se lleva a cabo a través de aplicaciones web albergadas en el servidor de internet del ISEI-IVEI y accesibles desde la web institucional. En ella se incluyen los cuestionarios del alumnado y del equipo directivo del centro. En los sucesivos estudios, estos cuestionarios se mantienen prácticamente inalterados, lo que permite la comparabilidad de los datos que se obtienen.